V souvislosti s nabytím účinnosti zákona 456/2011 Sb., o Finanční správě České republiky, který nahradí stávající zákon č. 531/1990 Sb., dojde od 1. ledna 2013 k významné reorganizaci české daňové správy. Stávající soustava územních finančních orgánů zanikne. Jejich kompetence převezmou tzv. orgány Finanční správy. Sídla jednotlivých úřadů se budou nacházet přímo v krajských městech a v hlavním městě Praze. Kompetence všech finančních úřadů budou dále rozšířeny např. o kontrolu dotací, finanční kontrolu, přezkoumávání hospodaření krajů, výběr pojistného atd.